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Illumina HiSeq 2000

HiSeq 2000


HiSeq 2000测序系统带来了前所未有的产量和突破性的用户体验。凭借Illumina久经考验且广泛采用的可逆终止法边合成边测序试剂,再加上创新的制造工艺,HiSeq 2000实现了行业最高的测序产量和最快的数据产生速率。人机交互设计特征以及最轻松的测序流程,为简便性及用户体验设立了全新的标准。

 


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系统描述

凭借创新的设计特征,HiSeq 2000成为最易于使用的新一代测序系统。

  • 流动槽很容易上样到真空控制的上样站中。
  • 只需要2分钟的手工操作时间,即可将预先配置足够200个循环使用的、即插即用型试剂安置入仪器冷冻室的架子上。
  • 简单的触摸屏用户界面,提供屏幕显示的每一步操作指示和嵌入的多媒体协助,简化了运行设置。
  • 实时的进展显示可提供一目了然的状态,而远程监控让单个用户能够通过任何一个浏览器或者可连接互联网的电话来检查多个系统的进展。
  • HiSeq 2000能够以单个或两个流动槽模式进行操作,赋予了无可比拟的实验灵活性和仪器可扩展性。
  • 可独立操控的流动槽让需要不同读长的多个应用能同时运行。
  • 内含Illumina高效且可扩展的数据分析方案,能将数十亿个碱基的原始测序数据转化成可发表的,在生物学上有意义的结果。

 

优势

前所未有的高产量

每次运行多达200 Gb,2×100 bp的读长,每天能达到25 Gb,每次运行达200亿个配对末端读取。

突破性的用户体验

预先配置、即插即用的试剂,简单的流动槽上样,便于指导每一步运行设置的触摸屏式用户界面,以及整合的配对末端流体学设计。

无可比拟的经济操作

单次运行即可以~30倍的覆盖度同时对两个人类基因组样品进行测序,每个基因组的费用不到1万美元;或同时绘制200个基因表达谱,每个样品不到200美元。

 


以前所未有的规模测序

HiSeq 2000让个体实验室也能承担最大最复杂的测序研究,而费用最低。处理更多样品及解码更大更复杂基因组的能力意味着几乎所有测序项目都触手可及。

Illumina 测序系统对比

会议消息

European Society of Human Genetics (ESHG)
May 28-31, 2011
Amsterdam, Netherlands

Genetic Epidemiology Meeting
May 30-June 1, 2011
Paris, France

International Rapeseed Congress
June 5-9, 2011
Praque, Czech Republic

现在的性能规格

HiSeq 2000系统的性能参数
参数
读长 单流动槽的运行时间 双流动槽的运行时间 双流动槽的产量
1 x 36 bp ~ 1.5 天 ~ 2 天 95-105 Gb
2 x 50 bp
~ 4.5 天 ~ 5.5 天 270-300 Gb
2 x 100 bp
~ 8.5 天 ~ 11 天 540-600 Gb

通量
对于2×100 bp的运行,每天最多55 Gb。

读取
最多30亿个通过过滤的簇以及最多60亿个末端配对读取

性能
HiSeq系统提供了最高产量的完美读取以及高于Q30的碱基
• 对于2×50 bp的运行,85%以上的碱基高于Q30*
• 对于2×100 bp的运行,80%以上的碱基高于Q30*
*利用Illumina PhiX库时HiSeq测序仪的安装规格,并利用适用于HiSeq的TruSeq v3 Cluster and SBS Kit,通过过滤的簇密度在610-678 K/mm2。随着样品质量、簇密度及其他实验因素不同,性能也会有所变化。基于以上因素,配对100 bp运行中高于Q30的碱基将会在80-90%之间变化,配对50 bp运行中高于Q30的碱基将会在85-95%之间变化。

服务与支持
Illumina将确保您的HiSeq 2000正确安装且符合要求,并将提供长期的维护和服务。目前在北美、欧洲和亚洲可享受到这种行业领先的支持。

HiSeq 2000 Workflow

配件&附件

cBot

IlluminaCompute

根据应用筛选
根据分析筛选

HiSeq 2000 Kits

TruSeq SBS kit-HS

TruSeq SBS kit-HS

TruSeq SBS-HS kits 包含立即可上样的试剂,能够在HiSeq 2000测序系统上利用边合成边测序的技术测定流动槽中每个簇的DNA序列。

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FC-401-1001
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Paired-End DNA Sample Prep Kit

Paired-End DNA Sample Prep Kit

Paired-End DNA Sample Prep Kit帮助构建末端配对测序的DNA文库,其插入片段大小为200-500bp。制备过程包括在补平的全基因组DNA片段的反向平行链上引入两个独特的测序引物结合位点和接头序列,然后进行凝胶法大小选择和纯化。

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PE-102-1001
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Small RNA Sample Prep Kit

Small RNA Sample Prep Kit

对于小RNA 发现和分析,Illumina的科学家已经设计出一个样品制备步骤,能够对已知和新颖的microRNA和其他非编码RNA(如piwi-interacting RNA和siRNA)进行测序。基于测序的Small RNA Sample Prep Kits赋予研究人员灵活性,让他们选择想要研究的小RNA长度,在一个通用的平台上实现了不同种类小RNA的大小聚焦或宽范围研究。

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FC-102-1009
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Multiplexing Sequencing Primers and PhiX Control Kit V2

Multiplexing Sequencing Primers 和 PhiX Control Kit V2

Multiplexing Sequencing Primers 和 PhiX Control Kit V2对Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit标记,然后在cBot或Cluster Station中扩增的样品进行测序。Illumina测序系统上的测序是完全自动化的。

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PE-400-2002
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Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit

Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit

Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit包含12个独特的寡核苷酸,对集中在一个流动槽通道中的文库进行“标记”。利用Genome Analyzer,单个流动槽中最多可测序96个样品。利用簇生成、Genome Analyzer及末端配对模块,这个多重测序过程可完全自动化。

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PE-400-1001
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Mate Pair Library Prep Kit v2

Mate Pair Library Prep Kit v2

Mate Pair Library Prep Kit包括生成插入片段大小为2-5kb的文库所需要的试剂。制备的文库包括由两个部分构成的短片段,它们最初是从基因组几千个碱基中分离出的。Mate Pairs是利用与末端配对测序方式相同的两个接头策略进行测序的。

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PE-112-2002
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Genomic DNA Sample Prep Kits

Genomic DNA Sample Prep Kits

从纯化的基因组DNA到DNA文库,Genomic DNA Sample Prep Kits包括构建单读测序的DNA文库所需的试剂。生成随机大小的DNA片段,补平,并在片段末端加上独特的接头。在一个简短的PCR富集之后,文库可立即上样。

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FC-102-1001
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ChIP-Seq DNA Sample Prep Kit

ChIP-Seq DNA Sample Prep Kit

染色质免疫共沉淀(ChIP)通过一个特定蛋白的结合选择性地发现DNA序列。ChIP-Seq DNA Sample Prep Kit帮助构建DNA文库。ChIP过程利用一个抗体和独特的寡核苷酸接头富集特异的DNA 蛋白交联复合物,这些寡核苷酸接头添加到与目的蛋白结合的一小段DNA上。

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IP-102-1001
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mRNA-Seq 8-Sample Prep Kit

mRNA-Seq 8-Sample Prep Kit

mRNA-Seq 8-Sample Prep Kit用于构建DNA文库,以便在Genome Analyzer上开展单读和末端配对测序。样品制备很简单,采用标准的分子生物学技术,只需要极少的手工操作时间。mRNA模板文库如同任何DNA样品一样可用Illumina测序技术测序。

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RS-100-0801
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TruSeq RNA Sample Prep Kits

TruSeq RNA Sample Prep Kits

TruSeq RNA Sample Prep Kits提供了一个简单而经济有效的方案,能从总RNA生成文库,并与Illumina无以伦比的测序产量兼容。与之前的方法相比,预混液试剂排除了大部分移液步骤,并减少了纯化次数,让手工操作时间降至最低。全新的自动化友好的流程形式能够平行处理最多96个样品。通过目前新一代测序平台上最易用的样品制备流程,这实现了经济、高通量的RNA测序研究。

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FC-122-1001
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TruSeq Exome Enrichment Kit

TruSeq Exome Enrichment Kit

TruSeq Exome Enrichment Kit支持了经济高效且可扩展的外显子组测序研究,提供了样品的预富集混合,以及最全面的外显子组覆盖、最高的均一性,和最低的DNA起始量需求。

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FC-121-1008
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TruSeq DNA Sample Prep Kits

TruSeq DNA Sample Prep Kits

TruSeq DNA Sample Prep Kits提供了一个简单、可扩展且经济有效的方案,能从基因组DNA生成文库,并与Illumina无以伦比的测序产量兼容。与之前的方法相比,预混液试剂排除了大部分移液步骤,并减少了纯化次数,让手工操作时间降至最低。全新的自动化友好的流程形式能够平行处理最多96个样品。

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FC-121-1001
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TruSeq Small RNA Sample Prep Kit

TruSeq Small RNA Sample Prep Kit

TruSeq Small RNA Sample Preparation Kit提供了一种简单且经济有效的方案,能从总RNA中直接生成小RNA文库。通过引入48个独特的索引,这些试剂盒实现了多重测序,让microRNA发现和图谱分析的通量与Illumina无以伦比的测序产量匹配。

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RS-200-0012
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TruSeq SR Cluster Kit v3-cbot-HS

TruSeq SR Cluster Kit v3-cbot-HS

TruSeq SR Cluster Kit v3–cbot –HS为样品与流动槽表面互补接头寡核苷酸的结合提供了试剂。

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GD-401-3001
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TruSeq PE Cluster Kit v3-cBot-HS

TruSeq PE Cluster Kit v3-cBot-HS

TruSeq PE Cluster Kit v3-cBot-HS为样品与流动槽表面互补接头寡核苷酸的结合提供了试剂。这样能在第一次测序运行后复制DNA链;复制的链用于另一个片段末端的测序。cBot将连接的DNA片段扩增成~1000个拷贝的克隆簇。

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PE-401-3001
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TruSeq SBS Kit v3-HS

TruSeq SBS Kit v3-HS

TruSeq SBS v3-HS kits包含了直接可上样的试剂,用于在HiSeq 2000测序系统上利用边合成边测序技术准确测定每个簇的DNA序列。

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软件

Illumina 引以为傲地提供了 系统和分析软件 旨在让您的数据质量和通量水平最大化。每台仪器都包括系统控制软件,以确保最佳性能。数据可通过Illumina用户友好的 GenomeStudio 软件第三方软件包来分析。

 

 

IDEA 挑战

Illumina推出了一项计划,旨在向科学界发起挑战,促其开发出新的、创造性的综合视图和数据分析技术。了解关于 iDEA 挑战的更多信息。

支持

Illumina的客户解决方案团队致力于为您提供所需的资源,以支持您的研究。即使在您第一次购买仪器之前,也能得到精通Illumina技术、科学应用、软件及硬件系统的科学家的支持。现场服务工程师能熟练地安装仪器,并使其符合要求,以保证您有一个功能完全的系统。现场应用科学家提供密集的培训,让实验室能快速精通掌握如何以空前的通量水平产生行业领先的数据质量。只需一个电话或邮件,技术支持科学家就能协助您设计目、剖剖析问题并阐释结果。

我们一直在努力超越您的预期,以期您可在实验室中将Illumina技术的影响力发扬光大。如需了解更多信息,请访问 支持 部分。  


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