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Illumina Genome Analyzer IIx

Genome Analyzer IIx


Genome AnalyzerIIx 以最简单最快速的流程提供了2 x 150 bp读长、和每个流动槽超过6.4亿个读取读数、最简单最快速流程的独特组合。高度最高的原始数据准确性和最大量的完美读数读取实现了广泛的高通量测序应用。大量文献的发表和广泛的应用范围充分的证明了 Genome AnalyzerIIx 是基因组检测和变异研究的最好的平台。

 


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应用: DNA 测序 , 基因调控分析 , 测序法转录组分析 , SNP发现和结构变异分析 , 细胞遗传学分析 , DNA-蛋白相互作用分析（ChIP-Seq） , 测序法甲基化分析

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Illumina的Genome Analyzer提供了强大的应用，可实现无限探索潜能，。获得意想不到的发现，。找到前所未有史无前例的答案，更快速地发表文献结果。

Illumina 测序系统对比

最新文献

Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences. Lister et al. 2009.

谁在使用Genome Analyzer使用者？

Laurent Farinelli, Ph.D.
Co-founder and CEO, Fasteris, Geneva, Switzerland, Fasteris

会议消息

Plant and Animal Genome Conference (PAG)
January 15-19, 2011
San Diego, CA

Advances in Genome and Biotechnology Conference (AGBT)
February 2-5, 2011
Marco Island, FL

流程 & 规格

 

Genome AnalyzerIIx 测序流程是基于三个简单的步骤。利用标准化的即用型试剂盒从几乎所有核酸样品中制备文库，所需时间不到6小时。克隆扩增利用了无需emulsion PCR的完全自动化cBot簇生成系统，不到4小时即可完成，而手工操作时间不到10分钟。测序则利用标准的测序试剂在流动槽内进行。

 

Genome Analyzer llx 的性能参数
               
 
读长 运行时间（天） 产量（Gb）
1 x 35 bp ~2 10 - 12
2 x 50 bp ~5 25 - 30
2 x 75 bp ~7 37.5 - 45
2 x 100 bp ~9.5 54 - 60
2 x 150 bp ~14 85 - 95
*利用TruSeq SBS V5 kit和PhiX库，GAIIx上通过过滤的簇密度在508-630 K/mm2时生成的测序产量。
通量
对于2×100 bp运行，每天最多6.5 Gb
读取
最多3.2亿个通过过滤的簇和最多6.4亿个末端配对读取
性能
Genome AnalyzerIIx 生成了可观量的高于Q30的碱基
•对于2×50 bp的运行，90%以上的碱基高于Q30
•对于2×100 bp的运行，85%以上的碱基高于Q30
服务与支持
Illumina将确保您的Genome AnalyzerIIx正确安装且符合要求，并将提供长期的维护和服务。目前在北美、欧洲和亚洲可享受到这种行业领先的支持。
 

根据应用筛选
根据分析筛选

Genome Analyzer IIx 试剂盒

TruSeq SBS Kit v5–GA

TruSeq SBS Kit v5–GA

Genome Analyzer IIx和Genome Analyzer Iie系统都需要TruSeq SBS V5 GA Kit。有了TruSeq试剂，Genome Analyzer IIx的用户能够将他们的读长延长至2×150 bp，并实现高达95 Gb的可作图数据。

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FC-104-5001
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Paired-End DNA Sample Prep Kit

Paired-End DNA Sample Prep Kit

Paired-End DNA Sample Prep Kit 帮助构建末端配对测序的DNA文库，其插入片段大小为200-500bp。制备过程包括在不铺的全基因组DNA片段的反向平行链上引入两个独特的测序引物结合位点和接头序列，然后进行凝胶法大小选择和纯化。

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PE-102-1001
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Small RNA Cluster Generation Kits

Small RNA Cluster Generation Kits

对于数字基因表达（DGE）：小RNA发现和分析，Small RNA Cluster Generation Kit将总RNA样品与流动槽表面的互补接头寡核苷酸结合。Cluster Station等温扩增连接的cDNA，生成的高密度模板簇可通过Illumina Genome Analyzer来测序。

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FC-103-4001
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Paired-End Cluster Generation Kit v4

Paired-End Cluster Generation Kit v4

Paired-End Cluster Generation Kit V4 为样品与流动槽上互补接头寡核苷酸的结合提供了试剂。这样能投在第一次测序运行后复制DNA链；复制的链用于另一个片段末端的测序。Cluster Station将连接的DNA片段扩增成~1000个拷贝的克隆簇。

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PE-203-4001
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Small RNA Sample Prep Kit

Small RNA Sample Prep Kit

对于小RNA发现和分析，Illumina的科学家已经设计出一个样品制备步骤，能够对已知和新颖的microRNAs和其他非编码RNAs（如piwi-interacting RNAs和siRNAs）进行测序。基于测序的Small RNA Sample Prep Kits赋予研究人员灵活性，让他们选择想要研究的小RNA长度，在一个通用的平台上实现了不同种类小RNA大小聚焦或宽范围研究。

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FC-102-1009
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Standard Cluster Generation Kit v4

Standard Cluster Generation Kit v4

提供了即用型的试剂，可将DNA文库样品与流动槽表面的互补接头寡核苷酸结合。该试剂盒中的预混合试剂提供了简化的工作流程，试剂配制和反应制备只需要总共10分钟的手工操作。

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GD-103-4001
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Multiplexing Sequencing Primers and PhiX Control Kit V2

Multiplexing Sequencing Primers 和 PhiX Control Kit V2

Multiplexing Sequencing Primers和PhiX Control Kit V2对Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit标记，然后在cBot或Cluster Station中扩增的样品进行测序。Illumina测序系统上的测序是完全自动化的。

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PE-400-2002
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Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit

Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit

Multiplexing Sample Preparation Oligonucleotide Kit 包含12个独特的寡核苷酸，对集中在一个流动槽通道中的文库进行标记。利用Genome Analyzer，单个流动槽中最多可测序96个样品。利用Cluster station、Genome Analyzer、及Paired-End Module，这个多重测序过程可完全自动化。

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PE-400-1001
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Mate Pair Library Prep Kit v2

Mate Pair Library Prep Kit v2

Mate Pair Library Prep Kit 包括生成大小为2-5kb的插入片段文库所需要的试剂。制备的文库包括由两个部分构成的短片段，它们最初是从基因组的几千个碱基中分离出来的。Mate Pairs是利用与末端配对测序方式相同的两个接头策略进行测序的。

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PE-112-2002
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Illumina Sequencing Kits v4

Illumina Sequencing Kits v4

Illumina Sequencing Kit v4 包含了即用型的试剂，适用于利用边合成边测序技术和Genome Analyzer精确测定流动槽中每个簇的DNA序列。该试剂盒中改良的试剂让研究人员能够比以前版本展开更长、高准确性的测序运行。

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FC-104-4001
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Genomic DNA Sample Prep Kits

Genomic DNA Sample Prep Kits

从纯化的基因组DNA到DNA文库，Genomic DNA Sample Prep Kits包括构建单独测序DNA文库的试剂。生成随机大小的DNA片段，补平，并在末端加上独特的接头。在一个简短的PCR富集之后，文库可立即上样。

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FC-102-1001
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Tag Profiling Sample Prep Kits

Tag Profiling Sample Prep Kits

Tag Profiling Sample Prep Kits 用于构建重组片段，此片段包含一个位置已知的20-或21-bp 独特cDNA标签，在两端加上确定的接头。通过两个限制性内切酶标签的构建选择，可获取几乎所有的mRNA。目前有完整的试剂盒或只包含必需的寡核苷酸的试剂盒可提供。

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FC-102-1005
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ChIP-Seq DNA Sample Prep Kit

ChIP-Seq DNA Sample Prep Kit

染色质免疫共沉淀（ChIP）通过一种特定蛋白的结合选择性发现DNA序列。ChIP-Seq DNA Sample Prep Kit帮助构建DNA文库。ChIP过程利用一个抗体和独特的寡核苷酸接头富集特异的DNA蛋白交联复合物，这些寡核苷酸接头是添加到与目的蛋白结合的一小段DNA上。

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IP-102-1001
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cBot Single Read Cluster Generation Kit

cBot Single Read Cluster Generation Kit

cBot Single Read Cluster Generation Kit 为DNA文库样品与流动槽表面的互补接头寡核苷酸结合提供了试剂。该试剂盒中预混合的96孔板格式的试剂提供了一个无须配制试剂的简化流程，手工操作时间总共只需10分钟。

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GD-300-1001
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cBot Paired-End Cluster Generation Kit

cBot Paired-End Cluster Generation Kit

cBot Paired-End Cluster Generation Kit 为样品与流动槽上的互补接头寡核苷酸结合提供了试剂。这样能够在第一次测序运行后复制DNA链；复制的链用于另一个片段末端的测序。Cluster Station将连接的DNA片段扩增成大约1000个拷贝的克隆簇。

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PE-300-1001
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mRNA-Seq 8-Sample Prep Kit

mRNA-Seq 8-Sample Prep Kit

mRNA-Seq 8-Sample Prep Kit 用于构建DNA文库，以开展Genome Analyzer上的单读和末端配对测序。样品制备很简单，采用标准的分子生物学技术，需要极少的手工操作时间。mRNA模板文库如同任何DNA样品一样可用Illumina测序技术测序。

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RS-100-0801
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TruSeq RNA Sample Prep Kits

TruSeq RNA Sample Prep Kits

TruSeq RNA Sample Prep Kits提供了一个简单而经济有效的方案，能从总RNA生成文库，并与Illumina无以伦比的测序产量兼容。与之前的方法相比，预混液试剂排除了大部分移液步骤，并减少了纯化次数，让手工操作时间降至最低。全新的自动化友好的流程形式能够平行处理最多96个样品。通过目前新一代测序平台上最易用的样品制备流程，这实现了经济、高通量的RNA测序研究。

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FC-122-1001
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TruSeq Exome Enrichment Kit

TruSeq Exome Enrichment Kit

TruSeq Exome Enrichment Kit支持了经济高效且可扩展的外显子组测序研究，提供了样品的预富集混合，以及最全面的外显子组覆盖、最高的均一性，和最低的DNA起始量需求。

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FC-121-1008
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TruSeq DNA Sample Prep Kits

TruSeq DNA Sample Prep Kits

TruSeq DNA Sample Prep Kits提供了一个简单、可扩展且经济有效的方案，能从基因组DNA生成文库，并与Illumina无以伦比的测序产量兼容。与之前的方法相比，预混液试剂排除了大部分移液步骤，并减少了纯化次数，让手工操作时间降至最低。全新的自动化友好的流程形式能够平行处理最多96个样品。

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FC-121-1001
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TruSeq SR Cluster Kit v5-CS-GA (single pack)

TruSeq SR Cluster Kit v5-CS-GA (single pack)

TheTruSeq SR Cluster Kit v5-CS-GA (single pack) provides ready-to-load reagents that bind DNA library samples to complementary adapter oligos grafted on the flow cell surface. The master-mixed reagents in this kit provide a streamlined workflow with a total of 10 minutes hands-on time for reagent preparation and setup.

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GD-203-5001
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TruSeq PE Cluster Kit v5-CS-GA (single pack)

TruSeq PE Cluster Kit v5-CS-GA (single pack)

The TruSeq PE Cluster Kit v5-CS-GA provides reagents that bind samples to complementary adapter oligos on the flow cell. These enable copying of the DNA strand after the first sequencing run; the copied strand is used to sequence the other fragment end. The Cluster Station amplifies attached DNA fragments to clonal clusters of ~1000 copies each.

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PE-203-5001
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TruSeq Small RNA Sample Prep Kit

TruSeq Small RNA Sample Prep Kit

TruSeq Small RNA Sample Preparation Kits provide a simple, cost-effective solution for generating small RNA libraries directly from total RNA. These kits enable multiplexed sequencing with the introduction of 48 unique indexes, allowing microRNA discovery and profiling throughput to match Illumina's unparalleled sequencing output.

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RS-200-0012
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TruSeq SR Cluster Kit v2–cBot -GA

TruSeq SR Cluster Kit v2–cBot -GA

The TruSeq SR Cluster Kit v2–cBot -GA provides reagents that bind DNA library samples to complementary adapter oligonucleotides grafted on the flow cell surface. The pre-mixed, 96-well plate format reagents in this kit provide a streamlined workflow with no reagent preparation and a total of 10 minutes hands-on time.

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GD-300-2001
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TruSeq PE Cluster Kit v2–cBot–GA

TruSeq PE Cluster Kit v2–cBot–GA

The TruSeq PE Cluster Kit v2–cBot-GA provides reagents that bind samples to complementary adapter oligos on the flow cell. These enable copying of the DNA strand after the first sequencing run; the copied strand is used to sequence the other fragment end. The cBot amplifies attached DNA fragments to clonal clusters of ~1000 copies each.

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PE-300-2001
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软件

Illumina 提供 系统分析软件 旨在最大程度确保您数据的品质及产量。每台仪器包括优化操作的系统控制软件。数据可以采用Illumina用户友好的 GenomeStudio 软件 或 第三方软件包进行分析。

 

 

IDEA挑战

Illumina推出了一项计划，旨在向科学界发起挑战，促其开发出新的、创造性的综合视图和数据分析技术。了解关于iDEA挑战 的更多信息。

资料

文献


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支持

Illumina的客户解决方案团队致力于为您提供所需的资源，以支持您的研究。即使在您第一次购买仪器之前，也能得到精通Illumina技术、科学应用、软件及硬件系统的科学家的支持。现场服务工程师能熟悉地安装仪器，并使其符合要求，以保证您有一个功能完全的系统。现场应用科学家提供密集的培训，让实验室能快速精通掌握如何以空前的通量水平产生行业领先的数据质量。只需一个电话或邮件，技术支持科学家就能协助您设计目录、剖析问题并阐释结果。

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