Genome Analyzer在您的开创性研究中曾起到什么样的作用?

我们的小组一开始感兴趣的是以单碱基对分辨率观察甲基化组。与其它的新一代测序系统不同，Genome Analyzer在三碱基对基因组测序上也表现得非常好，在亚硫酸氢盐转化之后你得到的基本是三碱基对基因组。然后我们决定，因为有太多小RNA指导的DNA甲基化，我们应该根据调控类型分层研究。

于是我们对小RNA组进行了测序。然后我们想回答最终的问题：DNA甲基化如何影响基因表达？于是我们又对转录组的全长mRNA部分进行了测序。有了所有的数据，我们才真正开始了解这些表观遗传标记的功能，以及它们如何导致实际基因表达的调控差异。我们真正触及了这些信号通路如何影响生物体的核心。如果没有Genome Analyzer，我们无法得到如此深度的数据组。

此系统让以前未进行过此类基因组研究的生物学家也能开展测序。因为我们能够在几天内通过几次运行来廉价地测序一个基因组，我们就能问出更深更大基因组范围的问题。

您是否计划对更多的“组”进行测序？

可以这么说，此时此刻我们已经找不到不能用Genome Analyzer来测序的东西了。生物指引我们去哪里，我们就去哪里，有了这个系统，我们能以单碱基分辨率去那里。我们不再受限，来询问分辨率是否足以进行这项研究，因为我们能降低到单碱基分辨率。