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Whole-Genome DASL Assay Kits
Whole-Genome DASL Assay Kits
| 系统: | iScan, BeadArray Reader, HiScanSQ |
|---|---|
| 技术: | BeadArray |
| 分析: | 全基因组DASL分析 |
| 应用: | FFPE样品分析 |
| 物种: | 人类 |
| 内含物: | 包括DAP，HumanRef-8 BeadChips以及扩增、杂交、洗涤和处理RNA样品所需的试剂。目前有包含或不含UDG酶的版本。 |
Whole-Genome DASL Assay凭借DASL 分析 中独特的PCR和标记步骤，可对低丰度和部分降解的RNA（如FFPE样品中的RNA）进行灵敏、可重复且经济有效的基因表达谱分析。一次可分析超过24,000个靶点。
Whole-Genome DASL Assay先用生物素化的oligo(dT)和随机九聚体引物将总RNA转化为cDNA。随后生物素化的cDNA与DASL Assy Pool（DAP）探针组一起退火，探针组中含有的寡核苷酸是特别为拷问转录本中每条靶序列而设计的。这些探针跨度约50个碱基，使其有可能识别部分降解的RNA。
在这之后，正确退火、分析特异的寡核苷酸得到延伸，并连接生成可扩增的产物。在PCR扩增过程中，这些模板被反应中的荧光引物标记。使用BeadArray Reader或iScan 系统 可扫描生成的PCR产物，以确定是否存在特定基因。
- DASL分析中RNA的建议用量有所不同，对于完整RNA，每次分析需100 ng，对于部分降解的RNA，则需要200 ng总RNA。
规格
了解如何使用该产品的更多信息。
| Whole-Genome DASL Assay Kit的成分： | |
|---|---|
| Catalog Number |
DA-903-0024
DA-903-1024 (W/UDG) DA-903-0096
DA-903-1096 (W/UDG) |
| Number of Samples |
24
96
|
| Ship at -65° to -85°C. Store at -15° to -25°C. | |
| MCS3 (cDNA Synthesis Master Mix 3) |
320 µl
680 µl
|
| OB1 (Oligo Hybridization and DNA Binding Buffer 1) |
3.5 ml
3.5 ml
|
| AM1 (Add Master Mix for Extension/Ligation 1 Reagent) |
4.0 ml
4.0 ml
|
| IP1 (Innoculate PCR Reagent) |
3.8 ml
3.8 ml
|
| UDG (Uracil DNA Glycosylase*) |
52 µl
52 µl
|
| SCM (Single Color Master Mix Reagent) |
3.2 ml
3.2 ml
|
| XC4 (XStain BeadChip Solution 4) |
350 ml
350 ml
|
| HCB (Humidity Control Buffer) |
2.8 ml
5.6 ml (2 x 2.8 ml)
|
| HYB (Hybridization Buffer) |
1.7 ml
1.7 ml
|
| Ship at -65° to -85°C. Store at -15° to -25°C. | |
| AM1 (Add Master Mix for Extension/Ligation 1 Reagent) |
15 ml
15 ml
|
| UB1 (Universal Buffer 1) |
25 ml
25 ml
|
| PS1 (Precipitation Solution 1) |
30 ml
30 ml
|
| MPB (Paramagnetic Particles B) |
2.2 ml
72.2 ml
|
| HumanRef-8 BeadChips |
3
12
|
| Ship at -65° to -85°C. Store at 2° to 8°C. | |
| MH1 (Make Hyb1 Reagent) |
7.0 ml (2 x 3.5 ml)
7.0 ml (24 x 3.5 ml)
|
| WC1 (Wash BeadChip Buffer) |
20.0 ml (4 x 5.0 ml)
20.0 ml (4 x 5.0 ml)
|
| HTW (High-Temperature Wash Buffer) |
325 ml
325 ml
|
| UB2 (Universal Buffer 2) |
300 ml
300 ml
|
| PB1 (Preparing BeadChip for Hybridization Buffer) |
950 ml
950 ml
|
|
*Supplied in DA-903-1024 and DA-903-1096 only. |
|
应用
FFPE 样品分析
福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）的样品是保存的组织样品，通常与疾病相关。这些样品中的多数代表了临床结果，与内在的表达谱相关联时是潜在的信息宝藏。FFPE样品中的RNA通常部分降解，因此对许多基因表达分析来说，转录分析是个挑战。利用基于久经考验的GoldenGate试剂的独特PCR和标记步骤，Illumina的DASL分析能够从降解的RNA样品中获得高质量的数据。DASL分析目前有Whole-Genome DASL Assay，一个固定内容的全基因组表达谱分析板。
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