产品

TruSeq Stranded Total RNA | 分析编码和非编码RNA

TruSeq Stranded Total RNA

可靠的、扩展自如的全转录组分析（RNA-Seq）解决方案适用于各种物种与样本类型，包括人类、小鼠与福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本。

11.5小时

分析时间

5.5小时

手动操作时间

0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。

起始量

详情请参见规格表

之前称为TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat（货号 号RS-122-2201, RS-122-2202和RS-122-2203）和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Gold（货 号RS-122-2301, RS-122-2302和RS-122-2303）分别称为 TruSeq Stranded Total RNA Human/Mouse/Rat和TruSeq Stranded Total RNA Gold。该产品的配置已更改。您需要单独购买文库制备和标签接头产品（而不是在试剂盒中购买）。

概述

TruSeq Stranded Total RNA提供了清晰的转录组视图，为总RNA测序分析提供了经济高效的一体化可扩展解决方案。

通过精确测量链方向进行全转录组分析

TruSeq Stranded Total RNA可兼容包括低质量DNA/RNA和福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本在内的多种样本，结合了TruSeq RNA技术与Ribo-Zero核糖体RNA去除方法的所有优点。该产品可分析编码和多种形式的非编码RNA，能够精确测量链方向，实现均匀覆盖，并发现高度可信的替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达等特征。

物种兼容性

TruSeq Stranded Total RNA专为人类、小鼠和大鼠测序而设计，但也可能适用于各类真核生物物种。

查看物种兼容表

适用于各种研究设计的灵活解决方案

TruSeq Stranded Total RNA有多种版本，可满足特定研究设计需要：

  • TruSeq Stranded Total RNA Human/Mouse/Rat 可去除细胞质rRNA

  • TruSeq Stranded Total RNA Gold 可去除细胞质和线粒体rRNA

  • 总RNA试剂盒兼容全新的唯一双重标签试剂盒IDT for Illumina - TruSeq RNA UD Indexes，该新试剂盒可对多达96个样本进行多重分析

快速、自动化的工作流程

一天内即可制备好用于因美纳测序的文库。Illumina认证方法可通过 我们的合作伙伴在一系列自动化平台上使用。

性能参数

Automation capability Liquid Handling Robots
Method Whole-Transcriptome Sequencing
Specialized sample types FFPE Tissue
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts
作用机制 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR
内容说明 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA
分析时间 11.5小时
多重分析 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本
手动操作时间 5.5小时
技术 Illumina测序
核酸类型 RNA
物种 小鼠, 人, 大鼠
物种详情 rRNA去除：去除人类、小鼠和大鼠rRNA
系统 NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
自动化详情 探索可用的自动化方法
说明 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。
起始量 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。

需要的产品

Illumina现提供模块化产品的预订，让您的工作流程变得灵活。您可以订购带有以下任何标签的以下任何文库制备产品。 
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应用

工作流程示例

1
制备

TruSeq Stranded Total RNA

2
测序
3
分析

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

RNA profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample)
Transcriptome analysis: 2-8 samples per run (based on 50 million reads per sample)

2×75 bp
NovaSeq 6000 System

RNA profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads.
Transcriptome analysis (samples per run, dual flow cell): S1: 64, S2: 128, S4: 400. Limited by index combinations (dual). Based on 50 million reads. 

≤ 2 × 100 bp

相关应用和方法

RNA测序

RNA-Seq使用新一代测序技术分析全转录组的表达，使研究人员能够检测已知或新的特性并对RNA进行定量。

低质量/FFPE RNA-Seq解决方案

查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。

文档

产品资料
Support documentation

比较

TruSeq Stranded Total RNA Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome
Automation capability Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
Method Whole-Transcriptome Sequencing Whole-Transcriptome Sequencing, Metatranscriptome Sequencing
Specialized sample types FFPE Tissue Microbiome Samples, Low-Input Samples, FFPE Tissue
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts
作用机制 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR 酶法rRNA去除，连接接头和标签
内容说明 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA
分析时间 11.5小时 约7小时
多重分析 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本 多达384个唯一双标签（UDI）
手动操作时间 5.5小时 ＜3小时
技术 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 RNA RNA
物种 小鼠, 人, 大鼠 小鼠, 人, 大鼠, Bacteria
物种详情 rRNA去除：去除人类、小鼠和大鼠rRNA

Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 

Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 
系统 NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
自动化详情 探索可用的自动化方法
说明 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。

用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 
起始量 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。

标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 

选择工具：

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

图

高质量链信息

技术平行分析间的高重复性反映了对RNA丰度一致、精确的测量。FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性，表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。显示 R2 值。

均匀覆盖转录本

TruSeq Stranded Total RNA在新鲜冷冻（FF，上图）和FFPE（下图）肿瘤以及匹配正常乳腺组织中的前1000个表达转录本中具有出色的覆盖度，比对链read＞98%。X轴：沿转录本的位置，Y轴：组合read的覆盖度百分比。

文库制备 (4)

TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat (48 Samples)

20020596

包含用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。

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TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat (96 Samples)

20020597

包含用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。

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TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold (48 Samples)

20020598

包括用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA和线粒体rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。单独购买标签接头和纯化磁珠。

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TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Gold (96 Samples)

20020599

包括用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA和线粒体rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。单独购买标签接头和纯化磁珠。

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标签接头 (4)

TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)

20019792

TruSeq Stranded RNA HT Kit 96样本接头孔板盒

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TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)

20020492

包括24个标签中的12个（标签：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19），用于制备48个单独的RNA样本。

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TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)

20020493

包括24个标签中的12个（标签：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27），用于制备48个单独的RNA样本。

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040871

包含96、8 bp标签，足以标记96个样本，与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022371 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进，其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。

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配套产品 (1)

Illumina Ribo-Zero plus rRNA Depletion Kit (96 Samples)

20037135

包括Ribo-Zero Plus去除模块，用于去除96个样本的人类、小鼠、大鼠以及细菌和珠蛋白转录本中的核糖体RNA。单独购买纯化磁珠、文库制备试剂和标签接头。如需完整的试剂盒，包括文库制备试剂，请订购Illumina Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plus试剂盒。

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服务 (1)

TruSeq Total RNA Training

15044069

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将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

NextSeq 500/550 v2.5 Kit

试剂v2.5试剂盒使用弹性流动槽，该流动槽可保持起始荧光强度，与早期版本相比提高了稳定性和性能。

TruSeq Stranded mRNA

从mRNA制备测序文库，获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。

TruSeq RNA Exome

为FFPE组织及其他低质量样本的RNA测序提供的可重现且经济的解决方案。只需10 ng的总RNA即可保证精确度。

有限使用标签许可证：此产品及其使用受Max Planck Gesellschaft所拥有且独家授权给New England Biolabs, Inc.并再授权给Illumina, Inc.的一个或多个已公告和/或待批准的美国和外国专利申请的约束。向Illumina, Inc.、其关联机构或其授权经销商和分销商购买此产品，即向买方转让使用买方所购数量产品和产品组件的权利（不论买方是学术性还是盈利性实体），该权利不可转让。购买此产品并不会转让前述专利或专利申请中针对产品生产的任何权利要求项下的许可。买方不得向第三方出售或以其他方式转让此产品及其组件，亦不得以其他方式将此产品用于下商业用途：（1）在生产中使用此产品或其组件；或（2）出于治疗或预防疾病的目的，在人或动物身上使用此产品或其组件。

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