订购NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
分析时间
手动操作时间
起始量
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin采用迅捷高效的测序文库制备工作流程,能从血液来源的总RNA中得到清晰、完整的转录组视图。
对血液来源的RNA进行全转录组分析需要去除两种在全血中含量较高的RNA——核糖体RNA(包括细胞质rRNA和线粒体rRNA)和球蛋白mRNA。
传统去除方法需要两个步骤才能完成。这意味着需要的试剂更多、工作流程更长、损失的RNA更多。TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin利用了Ribo-Zero测序化学技术,能通过一个简单、快速的步骤高效去除两种含量较高的RNA。
Automation capability | Liquid Handling Robots |
---|---|
Method | Whole-Transcriptome Sequencing |
Specialized sample types | Blood |
Variant class | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts |
作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
分析时间 | 11.5小时 |
多重分析 | 高通量试剂盒:使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒:混合最多12个样本。或混合24个样本(组A和B一起) |
手动操作时间 | 5.5小时 |
技术 | Illumina测序 |
核酸类型 | RNA |
物种 | 小鼠, 人, 大鼠 |
物种详情 | rRNA去除:消耗人、小鼠和大鼠rRNA(细胞质和线粒体)和球蛋白mRNA |
系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
说明 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
起始量 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
Illumina现提供模块化产品的预订,让您的工作流程变得灵活。您可以订购带有以下任何标签的以下任何文库制备产品。
仪器 | Recommended number of samples | Read length |
---|---|---|
NextSeq 550 System | RNA Profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample) |
2×75 bp |
NovaSeq 6000 System | RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads. |
≤ 2 × 100 bp |
分析编码RNA和多种形式的非编码RNA,获得完整的转录组视图。
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
RNA-Seq使用新一代测序技术分析全转录组的表达,使研究人员能够检测已知或新的特性并对RNA进行定量。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome | |
---|---|---|
Automation capability | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots |
Method | Whole-Transcriptome Sequencing | Whole-Transcriptome Sequencing, Metatranscriptome Sequencing |
Specialized sample types | Blood | Microbiome Samples, Low-Input Samples, FFPE Tissue |
Variant class | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts |
作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 酶法rRNA去除,连接接头和标签 |
内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
分析时间 | 11.5小时 | 约7小时 |
多重分析 | 高通量试剂盒:使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒:混合最多12个样本。或混合24个样本(组A和B一起) | 多达384个唯一双标签(UDI) |
手动操作时间 | 5.5小时 | <3小时 |
技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
核酸类型 | RNA | RNA |
物种 | 小鼠, 人, 大鼠 | 小鼠, 人, 大鼠, Bacteria |
物种详情 | rRNA去除:消耗人、小鼠和大鼠rRNA(细胞质和线粒体)和球蛋白mRNA |
Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本,包括:人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌(大肠杆菌和枯草芽孢杆菌)rRNA以及人类β珠蛋白转录本 Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本,包括:在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 |
系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
说明 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库,支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus,用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA,以便进行丰富的转录组分析。 |
起始量 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA,以获得最佳性能和FFPE样本 |
技术平行分析
FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性,表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。显示 R2 值。
均匀覆盖转录本
TruSeq Stranded Total RNA在新鲜冷冻(FF,上图)和FFPE(下图)肿瘤以及匹配正常乳腺组织中的前1,000个表达转录本中具有出色的覆盖度,比对链read>98%。X轴:转录本的不同位置,Y轴:结合read的覆盖度百分比。
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (48 Samples)
20020612
包括用于从血液样本中去除rRNA和球蛋白mRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录成cDNA的PCR预混液,以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
List Price:
Discounts:
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (96 Samples)
20020613
包括用于从血液样本中去除rRNA和球蛋白mRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录成cDNA的PCR预混液,以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)
20019792
TruSeq Stranded RNA HT Kit 96样本接头孔板盒
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)
20020492
包括24个标签中的12个(标签:2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19),用于制备48个单独的RNA样本。
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)
20020493
包括24个标签中的12个(标签:1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27),用于制备48个单独的RNA样本。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)
20020591
唯一双重标签(UDI),与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。UDI试剂盒以孔板形式供货,包含24个UDI(x4),足够用于96个样本。
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)
20022371
唯一双重标签(UDI),与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。UDI试剂盒以孔板形式供货,包含96个UDI,足够用于96个样本。
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