Correlation Engine

一个交互式组学知识库,利用高度精选的公共数据分析私人组学数据,帮助研究人员将数据置于生物学环境中。

概述

Correlation Engine是世界上最大的生物数据库之一,为生命科学研究人员提供了前所未有的大量高质量全基因组分析和富有洞察力的科学工具。知识库通过研究来自全基因组研究标准化分析的数十亿个数据点,实现了新的发现。

Correlation Engine提供:

  • 一个全面的平台,具有一套用于确定生物学背景的应用,一个不断增长的精选数据集库,支持多种物种和多组学数据集

  • 易于使用的图形用户界面,可利用引导式工作流程、按键式应用程序和API

  • 一种专有算法,可自动化并简化相关性分析,通过扫描私人数据和数千个公共数据集来寻找类似的见解

加速从组学数据到发现的旅程

利用Correlation Engine的256K个精选组学特征快速关联您的数据并提出数据相关问题。


性能参数

合规性认证

应用

Correlation Engine提供了一个易于使用的交互式基因组学分析平台,可将私人数据置于生物学背景下,并包含高度精选的公共数据。应用程序支持早期研究,以识别疾病机制、药物靶点以及预后或预测生物标志物。

软件产品组合

1
实验室
2
运行
3
分析
4
解读

Correlation Engine

交互式组学知识库,将私人组学数据置于生物学背景下,并具有高度精选的公共数据。


主要使用案例

生物标志物发现和验证

识别关键生物标志物并发现特征中的哪些基因可以为主要疾病区域、最佳治疗靶点和作用机制提供最佳标志物。

药物再利用

寻找反向相关性,发现表明药物新用途的基因-疾病化合物关联。

大学研究文库

使全校范围内的研究人员能够查询和使用高度精选的公共组学数据,将其数据进行背景分析,以加速他们的研究项目并生成出版物。

药物安全性和毒性基因组学

利用公共毒理学研究来评估化合物特征,并使用精选的研究或元分析应用程序来发现与其他已知毒性基因组特征的重叠。


相关应用和方法

关联多种数据类型

对于给定的查询,可以快速识别新的相关性和关联,揭示基因、疾病、化合物、组织和通路之间的数据驱动的关联。

Body Atlas

身体图谱提供了有关基因表达位置及其在该位置内的表达水平的见解。

Disease Atlas

疾病图谱提供了与查询数据相关的疾病、性状和病症之间的相关性。

Pharmaco Atlas

药物图谱有助于发现化合物、对化合物的基因组和表观基因组反应,以及与查询数据相关的治疗。

相关资源

我们的变异注释和分析软件工具可以帮助研究人员从大量的基因组数据中提取和报告生物学见解。

利用Correlation Engine探索复杂的多组学分析工作流程。

 

常见问题解答

不能。目前,Correlation Engine仅支持人类生物学和动物模型系统。但是,该平台可用于分析宿主对感染的反应。

Correlation Engine支持RNA表达(RNA-Seq)、基因分型/SNP GWAS、DNA蛋白相互作用分析、体细胞突变分析和DNA甲基化分析。 

Correlation Engine将交互式且易于使用的界面和预先构建的工作流程与一整套高质量的精选公共数据相结合,实现快速的结果,让用户能够毫不拖延地进行下一次实验。 

Correlation Engine有超过23,000项研究。Correlation Engine中的研究每周更新。 

Correlation Engine可识别大多数公共和标准商业平台标识符,包括来自大多数Affymetrix、Illumina、Agilent和GE Healthcare平台的NCBI基因ID、基因符号、NCBI登录号、ENSEMBL ID、RefSeq标识符、IPI ID和自定义ID。

Correlation Engine使用专有的基于秩的统计数据来计算导入的数据与所有其他实验数据之间的关联。这使您可以将实验结果置于世界实验的背景下,以验证结果、发现新的关联并设计新的实验。它会将您的数据与所有生物组相关联,从而发现构成您研究的基因或蛋白质之间的共同特征。

Correlation Engine对来自PubMed的1900多万篇摘要和来自PubMed Central的130,000多篇全文文献进行了索引。对于文献搜索,Correlation Engine使用多种启发法,包括:

  • 广泛的本体,术语和同义词以及术语层次结构之间的关系
  • 定制、特定域的停止词列表和分析仪,强调本体术语
  • 发表论文的期刊的整体权威
  • 发布日期
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