De Novo 测序

读长、读取深度，以及灵活的末端配对插入片段大小的独特组合让Genome Analyzer的数据很适合de novo测序。该系统无以伦比的原始读取准确性能够自信高效地产生高质量的长contig拼接。有了每次运行产生高达18 Gb 75+ bp末端配对数据的能力，任何实验室都能快速经济地对任何大小的基因组进行de novo测序。

多个 新颖的算法 已开发出，能够最佳地利用 Illumina 测序技术的优势进行de novo拼接。利用这些工具，研究人员展示了Genome Analyzer的数据在拼接小基因组和大的复杂基因组上的作用。